很大，江宁和六合的市民卡在南京主城区是不能使用的，医保刷卡你只能回江宁刷，看病的话只能去江宁看，市区只有几个医院可选。养老金缴纳也和主城区的不同，自然享受的待遇也不同。毕竟江宁和六合还没并入南京主城区，具体的情况你可以去咨询当地劳动保障局